MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 908 chromosome

Total Repeats: 32040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017357	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017357	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017357	GAGC	2	8	72	79	25 %	0 %	50 %	25 %	384890374
4	NC_017357	CATT	2	8	158	165	25 %	50 %	0 %	25 %	384890374
5	NC_017357	GAT	3	9	166	174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890374
6	NC_017357	TG	3	6	182	187	0 %	50 %	50 %	0 %	384890374
7	NC_017357	TTCT	2	8	303	310	0 %	75 %	0 %	25 %	384890374
8	NC_017357	GTT	2	6	349	354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890374
9	NC_017357	T	7	7	362	368	0 %	100 %	0 %	0 %	384890374
10	NC_017357	T	7	7	390	396	0 %	100 %	0 %	0 %	384890374
11	NC_017357	TTC	2	6	400	405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890374
12	NC_017357	ACA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384890374
13	NC_017357	C	6	6	444	449	0 %	0 %	0 %	100 %	384890374
14	NC_017357	AAT	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890375
15	NC_017357	C	6	6	686	691	0 %	0 %	0 %	100 %	384890375
16	NC_017357	TAA	2	6	694	699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890375
17	NC_017357	CT	3	6	735	740	0 %	50 %	0 %	50 %	384890375
18	NC_017357	CTT	2	6	844	849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890375
19	NC_017357	TGA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890375
20	NC_017357	AAAT	2	8	956	963	75 %	25 %	0 %	0 %	384890376
21	NC_017357	TG	3	6	1054	1059	0 %	50 %	50 %	0 %	384890376
22	NC_017357	AAC	2	6	1068	1073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384890376
23	NC_017357	CCGCAG	2	12	1087	1098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384890376
24	NC_017357	CCA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384890376
25	NC_017357	GCT	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384890376
26	NC_017357	CA	3	6	1270	1275	50 %	0 %	0 %	50 %	384890376
27	NC_017357	T	6	6	1287	1292	0 %	100 %	0 %	0 %	384890376
28	NC_017357	T	6	6	1391	1396	0 %	100 %	0 %	0 %	384890376
29	NC_017357	GGC	2	6	1447	1452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384890376
30	NC_017357	GTT	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890376
31	NC_017357	TAG	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890376
32	NC_017357	CTT	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890376
33	NC_017357	TTC	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890377
34	NC_017357	A	7	7	1821	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	384890377
35	NC_017357	ATTATA	2	12	1839	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	384890377
36	NC_017357	CCTG	2	8	1854	1861	0 %	25 %	25 %	50 %	384890377
37	NC_017357	GCCA	2	8	1877	1884	25 %	0 %	25 %	50 %	384890377
38	NC_017357	TCA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890377
39	NC_017357	TGAA	2	8	1918	1925	50 %	25 %	25 %	0 %	384890377
40	NC_017357	GTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890377
41	NC_017357	TTC	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890377
42	NC_017357	TGG	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890377
43	NC_017357	TCA	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890377
44	NC_017357	AATG	2	8	2108	2115	50 %	25 %	25 %	0 %	384890377
45	NC_017357	AGG	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384890377
46	NC_017357	GATTA	2	10	2292	2301	40 %	40 %	20 %	0 %	384890377
47	NC_017357	ATTC	2	8	2393	2400	25 %	50 %	0 %	25 %	384890377
48	NC_017357	TTC	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017357	A	8	8	2586	2593	100 %	0 %	0 %	0 %	384890378
50	NC_017357	CTTT	2	8	2603	2610	0 %	75 %	0 %	25 %	384890378
51	NC_017357	T	7	7	2682	2688	0 %	100 %	0 %	0 %	384890378
52	NC_017357	TGA	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890378
53	NC_017357	AGC	2	6	2822	2827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384890378
54	NC_017357	A	6	6	2873	2878	100 %	0 %	0 %	0 %	384890378
55	NC_017357	AG	3	6	2992	2997	50 %	0 %	50 %	0 %	384890378
56	NC_017357	GTG	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890378
57	NC_017357	T	6	6	3064	3069	0 %	100 %	0 %	0 %	384890378
58	NC_017357	AGA	2	6	3109	3114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890378
59	NC_017357	GTG	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890378
60	NC_017357	GCC	2	6	3177	3182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384890378
61	NC_017357	GAAA	2	8	3292	3299	75 %	0 %	25 %	0 %	384890379
62	NC_017357	GAAA	2	8	3367	3374	75 %	0 %	25 %	0 %	384890379
63	NC_017357	TG	3	6	3474	3479	0 %	50 %	50 %	0 %	384890379
64	NC_017357	GTT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890379
65	NC_017357	ATC	2	6	3707	3712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890379
66	NC_017357	AGAA	2	8	3823	3830	75 %	0 %	25 %	0 %	384890379
67	NC_017357	A	6	6	3861	3866	100 %	0 %	0 %	0 %	384890379
68	NC_017357	CAG	2	6	3869	3874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384890379
69	NC_017357	A	6	6	3911	3916	100 %	0 %	0 %	0 %	384890379
70	NC_017357	ATT	2	6	3951	3956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890379
71	NC_017357	TGT	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890379
72	NC_017357	GGC	2	6	4024	4029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384890379
73	NC_017357	GGT	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017357	TAT	2	6	4178	4183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017357	TGG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017357	TGG	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017357	GTG	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017357	ACC	2	6	4492	4497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017357	GGT	2	6	4505	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017357	T	8	8	4646	4653	0 %	100 %	0 %	0 %	384890380
81	NC_017357	TAA	2	6	4852	4857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890381
82	NC_017357	TTA	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890381
83	NC_017357	T	7	7	4878	4884	0 %	100 %	0 %	0 %	384890381
84	NC_017357	A	6	6	4889	4894	100 %	0 %	0 %	0 %	384890381
85	NC_017357	A	6	6	4905	4910	100 %	0 %	0 %	0 %	384890381
86	NC_017357	TGT	2	6	4944	4949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017357	TCATT	2	10	4955	4964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017357	GTTT	2	8	4967	4974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017357	CCCT	2	8	5033	5040	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_017357	AAG	2	6	5042	5047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017357	T	7	7	5051	5057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017357	ACTA	2	8	5092	5099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017357	ATC	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017357	A	7	7	5143	5149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017357	A	6	6	5158	5163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017357	A	7	7	5174	5180	100 %	0 %	0 %	0 %	384890382
97	NC_017357	CTT	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384890382
98	NC_017357	T	6	6	5207	5212	0 %	100 %	0 %	0 %	384890382
99	NC_017357	GTT	2	6	5265	5270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890382
100	NC_017357	TAA	2	6	5334	5339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384890382
101	NC_017357	TTA	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890382
102	NC_017357	GTG	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890382
103	NC_017357	GC	3	6	5523	5528	0 %	0 %	50 %	50 %	384890382
104	NC_017357	TGT	2	6	5582	5587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890382
105	NC_017357	GTT	2	6	5637	5642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890382
106	NC_017357	GCT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384890382
107	NC_017357	AGT	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384890382
108	NC_017357	TTGAT	2	10	5737	5746	20 %	60 %	20 %	0 %	384890382
109	NC_017357	GCTTGC	2	12	5767	5778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384890382
110	NC_017357	GCG	2	6	5840	5845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384890382
111	NC_017357	TTGCT	2	10	5854	5863	0 %	60 %	20 %	20 %	384890382
112	NC_017357	CGA	2	6	5891	5896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384890382
113	NC_017357	TCA	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890382
114	NC_017357	TGT	2	6	6125	6130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890382
115	NC_017357	CTG	2	6	6157	6162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384890382
116	NC_017357	CAC	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384890382
117	NC_017357	TAT	2	6	6203	6208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890382
118	NC_017357	GTTT	2	8	6211	6218	0 %	75 %	25 %	0 %	384890382
119	NC_017357	CCCATT	2	12	6276	6287	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384890382
120	NC_017357	ATT	2	6	6417	6422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384890382
121	NC_017357	TGCCAT	2	12	6452	6463	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384890382
122	NC_017357	CCG	2	6	6506	6511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384890382
123	NC_017357	ATCG	2	8	6594	6601	25 %	25 %	25 %	25 %	384890382
124	NC_017357	GCT	2	6	6621	6626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384890382
125	NC_017357	CGTT	2	8	6629	6636	0 %	50 %	25 %	25 %	384890382
126	NC_017357	GTT	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384890382
127	NC_017357	A	6	6	6768	6773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017357	AGC	2	6	6801	6806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017357	GA	8	16	6807	6822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017357	T	7	7	6832	6838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017357	T	13	13	6921	6933	0 %	100 %	0 %	0 %	384890383
132	NC_017357	T	6	6	6964	6969	0 %	100 %	0 %	0 %	384890383
133	NC_017357	GTTT	2	8	6974	6981	0 %	75 %	25 %	0 %	384890383
134	NC_017357	GGT	2	6	6983	6988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384890383
135	NC_017357	TTTTA	2	10	7007	7016	20 %	80 %	0 %	0 %	384890383
136	NC_017357	T	6	6	7055	7060	0 %	100 %	0 %	0 %	384890384
137	NC_017357	C	8	8	7102	7109	0 %	0 %	0 %	100 %	384890384
138	NC_017357	AAG	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384890384
139	NC_017357	A	6	6	7127	7132	100 %	0 %	0 %	0 %	384890384
140	NC_017357	CAT	2	6	7155	7160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384890385
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273	NC_017357	T	6	6	13137	13142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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